İstanbul 13. Ağır Ceza Mahkemesi'nin gerekçesinde, Anayasa Mahkemesi kararlarının Resmi Gazete'de yayımlanmasından sonra hüküm ve sonuç doğuracağının ifade edildiğine yer verilen dilekçede, şöyle denildi:
"Ancak Anayasa Mahkemesi iç tüzüğünün 58. maddesine göre Genel Kurul kararlarından yalnızca iptal ve itiraz başvurularına ilişkin olanlarının Resmi Gazete'de yayımlanma zorunluluğu vardır. Dolayısıyla 13. Ağır Ceza Mahkemesi'nin Anayasa Mahkemesi Başkanlığı yerine geçerek ihlale ilişkin kararın Resmi Gazete'de yayımlanmasından sonra hüküm ve sonuç doğuracağına karar vermesi düşünülemez."
Anayasa Mahkemesi'nin hak ihlali kararının ardından, İstanbul 13. Ağır Ceza Mahkemesi, FETÖ/PDY'nin yayın organı olduğu gerekçesiyle kayyuma devredildikten sonra kapatılan Zaman gazetesinin eski yönetici ile yazarlarının da sanık olarak bulunduğu davada tutuklu yargılanan gazeteci Şahin Alpay'ın durumunu yeniden değerlendirmiş ve tutukluluk halinin devamına karar vermişti.
